北京理工大学2002年获批国家示范性软件学院，同时设立软件工程专业。2003年9月和2006年5月分别通过教育部组织的示范性软件学院中期评估和验收，2007年获批教育部财政部第一批高等学校软件工程特色专业建设点，2013年获批工信部重点专业。2018年计算机学院、软件学院及网络科学与技术研究院合并成立新的计算机学院，软件工程专业并入计算机学院。
2011年2月，软件学院获准首批设立软件工程一级学科博士点，本专业依托软件工程一级学科点进行建设，2017年，软件工程学科点撤销，本专业依托计算机科学与技术一级学科点进行建设。目前建有1个北京市实验教学示范中心，2个北京市重点实验室：数字表演与仿真技术实验室及软件安全工程技术实验室。实验室管理规范，设备充足、性能优良，维护更新及时，能够满足教学需要。专业还依托于网络信息安全国防科技工程中心、网络等级保护关键技术国家工程实验室、北京市大学生软件科技创新创业基地和4个企业共建实验室，另建有5个与企业单位共建的校内外实习实践教学基地，企业承担了一定的教学任务。企业指导教师均具有实际的大型软件系统开发或项目管理经验，并能在学生实习期间严格要求，完成指导工作。
2013年本专业成为“卓越工程师教育培养计划”试点专业。2017年本专业按计算机大类专业招生（含计算机科学与技术、软件工程、物联网工程3个专业），2018年本专业并入信息科学技术大类专业招生。大类招生在大一结束后进行专业确认，本专业每年学生数180人左右，全部学生进入卓越计划培养。
本专业自成立以来，已培养毕业生近3000人，目前有在校本科生552名（大二——大四三个年级）。近年来，本专业以OBE思想引领本科人才培养，加强专业内涵建设，通过对教师、学生、校友、用人单位的调查，不断修订专业培养目标，逐步实现了以学习者为中心的培养体系。
本专业面向全体学生，大力组织学生科技竞赛。近年来，每年有近300人次学生在软件科技创新基地开展创新实践活动。五年来，共获得1552人次省部级以上科技竞赛奖励，其中国际级奖励144人次、国家级奖励1296人次，学生发表学术论文21篇，申报发明专利16项，获得软件著作权25项。学生课余参加科技竞赛活动实现了人数多、内容广、水平高、投入深的良好局面。近年来，本专业在落实办学特色、校企合作、人才培养、学生就业等方面，接待了国内20多家单位的学习取经和百余次参观访问，得到了同行和企业界的高度评价。办学经验被中央电视台、中国教育电视台、光明日报、中国教育报等多家媒体进行了报道。
软件工程专业于2016 年11 月14 日至16 日完成了专业认证的现场考察工作，并获得了2017 年1 月至2019 年12 月3年有效期的专业认证。
专业负责人：赵小林，男，副教授，毕业于北京理工大学计算机科学工程系，2004-2005年在美国加州大学圣迭戈分校（UCSD）做访问学者，研究方向为网络空间安全、软件安全理论，近3年主讲本科课程数据库原理与设计、应用系统开发实践、软件工程专业实践。